makes microbiology easier

Techniques

Les capacités du laboratoire reposent sur 3 plateaux techniques

MICROBIOLOGIE

La plateforme de microbiologie dispose des outils pour caractériser et quantifier les micro-organismes, qu’il s’agisse de bactéries, de levures ou de moisissures, issues de différents types d’échantillons. Cette plateforme nous permet également de modifier le génome de souches bactériennes.

Caractérisation de micro-organismes :
           • identification
           • phénotypage : morphologie – 
              caractéristiques physiologiques et métaboliques
           • génotypage moléculaire
           • évaluation de l’antibiorésistance
           • mesure de la production de facteurs de virulence

Isolement et quantification de micro-organismes par culture sur milieux spécifiques

Modification de génomes bactériens

BIOLOGIE MOLECULAIRE

Quel que soit l’échantillon biologique (sang, culots cellulaires, micro-organismes, biopsies, sols, fèces …), Smaltis dispose des outils pour en extraire les acides nucléiques, les quantifier par mesure d’absorbance et vérifier leur intégrité. Une fois préparés, ils peuvent être utilisés comme matrice pour différentes applications.

›  Préparation d’acides nucléiques

›  Amplification, détection et séquençage de fragments génomiques par PCR et qPCR, amplification d’ADN circulaire par Rolling Circle Amplification (RCA PCR)

›  Quantification de transcrits de gènes d’intérêt par RT-qPCR et évaluation de leur expression relative

›  Etudes métagénomiques ou métatranscriptomiques grâce au séquençage haut débit

›  Construction de vecteurs d’expression

BIOLOGIE CELLULAIRE

Grâce à sa plateforme de biologie cellulaire, Smaltis vous propose différents modèles d’études sur cellules eucaryotes, permettant de vous accompagner dans l’évaluation de l’infection bactérienne et dans l’analyse de la réponse cellulaire face à différents composés ou microorganismes.

›  Tests d’adhésion et invasion :
           •  divers modèles cellulaires :  cellules intestinales,
               pulmonaires, cutanées, macrophagiques…
           •  quantification par dénombrement bactérien
               et immunomarquage

› Evaluation de cytotoxicité bactérienne et chimique

Réponse cellulaire à l’infection : génomique, protéomique