L’isolement et la quantification d’un ou plusieurs micro-organismes présents dans un échantillon est souvent nécessaire lorsque l’on veut évaluer l’impact d’un composé, d’un traitement physique, chimique ou biologique, de changements environnementaux ou plus simplement vérifier l’absence de contamination microbienne. SMALTIS a donc développé des outils et des méthodes pour quantifier directement ou indirectement les populations microbiennes présentes dans vos échantillons.
Méthode
A partir d’échantillons (cultures liquide sou co-cultures, solutions d’acides nucléiques, échantillons de peau (explants, reconstruites ou écouvillonnages), échantillons de sols, prélèvements de surface…) nous mettons en place et validons avec vous des méthodes de prélèvement et d’extraction spécifiques des micro-organismes d’intérêt.
Ces derniers sont ensuite quantifiés :
Directement par culture sur des milieux spécifiques (cultures des cellules viables ou Unité Formant Colonie (UFC))
Indirectement via la technique de PCR en temps réel en ciblant des gènes spécifiques des espèces d’intérêt ou les technologies de séquençage à haut-débit.
Réalisations
– Quantification par culture des bactéries présentes sur des explants de peau préalablement infectés et maintenus en survie.
– Quantification par qPCR de 4 espèces bactériennes dans des co-cultures.
– Quantification par culture et qPCR de 2 espèces bactériennes présentes dans des échantillons de peaux reconstruites.
– Vérification de l’absence de contamination bactérienne et fongique dans des solutions d’acides nucléiques (Test de biocharge – Bioburden selon les normes ISO 11737-1 et Ph.Eur.2.6.1).
– Titration de solutions de bactériophages par Phage Plaque Assay.
– Evaluation de la contamination microbienne (air et surface) de bâtiment ayant des activités de services.
– Evaluation de la contamination microbienne (air et surface) de chambres d’hôtel.
– Etude du microbiote cutané du front de sujets traités ou non par un produit cosmétique.
– Isolement et quantification des coliformes présents dans des biopsies.
Principales espèces bactériennes déjà étudiées :
– Staphylococcus aureus
– Staphylococcus epidermidis
– Staphylococcus hominis
– Propionibacterium acnes
– Malassezia pachydermatis
– Bacillus oleronius
– Escherichia coli
