makes microbiology easier

Exploration du microbiote

Accompagnement de projets liés au microbiote

Smaltis soutient les différentes étapes du développement de vos produits dérivés ou agissant sur le microbiote, afin d’alimenter les données sur vos candidats et de constituer les dossiers réglementaires nécessaires à leur mise sur le marché.

Composés et microbiotes étudiés

Smaltis accompagne ainsi le développement de divers composés ou microorganismes. Selon leur cible, différents microbiotes et bactéries peuvent être étudiés, dans un contexte pathologique ou non.

Microbiotic Medicinal Products – Live Biotherapeutic Products – Non-Living Biotherapeutic Products –

Prébiotiques, Probiotiques, Postbiotiques, Synbiotiques – Phages – Autres composés

Microbiote Intestinal, Vaginal, Oral, Pulmonaire, Urinaire...

Notre offre

Screening & Caractérisation de souches

Génotype, phénotype, identification biochimique, séquençage complet du génome (whole genome sequencing), activité biologique, production de métabolites, sensibilité aux antibiotiques, virulence, transfert de gènes, stabilité génétique, gastro-résistance, adhésion, présence de plasmides et d’éléments génétiques mobiles, viabilité, effet antagoniste vis-à-vis de bactéries pathogènes…

Optimisation de souches bactériennes

Suppression de séquences phagiques ou d’autres contaminants génomiques, suppression de gènes liés à la diffusion, réduction de la transmission d’antibiorésistance et de pathogénicité, atténuation de facteurs de virulence, élimination de plasmides, insertion de gènes pour la production de protéines recombinantes, optimisation de l’expression génique…

Mécanisme d’action

Outils et Modèles conçus pour évaluer l’efficacité.
Screening fonctionnel – Dose seuil – Description des interactions avec les bactéries – Détermination de biomarqueurs – Bioassays – Diagnostic compagnon

Description de microbiotes

Next Generation Sequencing pour décrire le microbiote par des analyses de métagénomique et métatranscriptomique
Etudes post-métagénomiques pour expliquer l’évolution d’un microbiote induite par un candidat

Contrôles analytiques

Stabilité, pureté, identité, niveau d’efficacité, taux d’expression de protéines recombinantes…

Développement de procédés

Mode opératoire spécifique pour monitorer les souches ou composés issus de souches
Détermination des meilleures conditions de culture
Partenariat avec d’autres sociétés pour la production de protéines recombinantes

Outils et Modèles

Grâce à ses plateformes de microbiologie, biologie moléculaire et biologie cellulaire, Smaltis peut travailler à partir de différents modèles et échantillons, et proposer des modes opératoires spécifiquement adaptés aux projets. 

Modèles :

› Cultures & co-cultures de bactéries aérobies ou anaérobies et levures d’intérêt
          → Collections de bactéries disponibles
          → Construction de souches sur-mesure

› Infections cellulaires
         → Modèles d’infection et de réponse cellulaire sur cellules intestinales (Caco2, T84, HT29), pulmonaires (A549, NCI-H820), macrophages (macrophages murins J774A.1, monocytes THP-1)…

› Echantillons biologiques
          → Biopsies, explants de peau, selles…

Exemple de réalisation

Prestation dans le cadre de la maladie de Crohn : accompagnement du développement d’un composé interagissant avec la protéine FimH des souches bactériennes E. coli responsables de la sur-inflammation aigüe observée chez les patients atteints de cette pathologie.

Etude préclinique :
Evaluation des propriétés d’adhésion et d’invasion de souches AIEC (E. coli adhérents invasifs), sur une lignée de cellules épithéliales intestinales
Développement d’un test d’agrégation pour visualiser l’interaction entre le composé et les protéines FimH des souches d’intérêt

Etude clinique phase I b :
Développement d’une méthode pour isoler les bactéries “biomarqueurs” à partir de biopsies intestinales

Poursuite des travaux dans le cadre de l’étude clinique de phase II

Composé développé par les sociétés Enterome puis Takeda